济南综合保税区于2012年5月15日经国务院批准设立，总规划围网面积5.22平方公里，由原济南出口加工区转型升级而成，2013年12月25日顺利通过国家十部委联合验收。

济南综合保税区具有“保税加工、保税物流、货物贸易、服务贸易、口岸通关”五大功能，是目前国内仅次于自贸区的对外开放层次最高、政策最优惠、功能最齐全、运作最灵活、通关最便捷的海关特殊监管区域。

2017年5月，市委市政府决定将济南综合保税区整体迁建至临空经济区，整合发挥综合保税区和机场两大引擎作用，助推临空产业发展，打造空港型综合保税区。

济南综合保税区紧邻济南遥墙国际机场，坐拥航空、高铁、高速公路、城市轨道交通、水运等多种交通方式无缝衔接之便利，具有“接纳东西南北，交流左右纵横”的独特区位优势。